肿瘤纯度:是指肿瘤组织中肿瘤细胞所占的比例。
肿瘤组织中除了肿瘤细胞之外还有免疫细胞、基质细胞、间质细胞等非肿瘤细胞,共同影响肿瘤发生发展。
研究显示肿瘤纯度与肿瘤患者的临床特征、基因组表达和生物学特性均显著相关,忽视肿瘤纯度的影响可导致肿瘤基因分型、复发风险及疗效预测等过程产生系统性偏倚。
计算肿瘤纯度用estmate包。
以下是具体教程。
##estimate估计肿瘤的TNM分期,也就是肿瘤的纯度。
##安装estimate包
library(utils)
rforge
肿瘤纯度:是指肿瘤组织中肿瘤细胞所占的比例。
肿瘤组织中除了肿瘤细胞之外还有免疫细胞、基质细胞、间质细胞等非肿瘤细胞,共同影响肿瘤发生发展。
研究显示肿瘤纯度与肿瘤患者的临床特征、基因组表达和生物学特性均显著相关,忽视肿瘤纯度的影响可导致肿瘤基因分型、复发风险及疗效预测等过程产生系统性偏倚。
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