ESTIMATE肿瘤纯度预测

时间:2021-7-9 作者:qvyue

肿瘤纯度:是指肿瘤组织中肿瘤细胞所占的比例。
肿瘤组织中除了肿瘤细胞之外还有免疫细胞、基质细胞、间质细胞等非肿瘤细胞,共同影响肿瘤发生发展。
研究显示肿瘤纯度与肿瘤患者的临床特征、基因组表达和生物学特性均显著相关,忽视肿瘤纯度的影响可导致肿瘤基因分型、复发风险及疗效预测等过程产生系统性偏倚。

计算肿瘤纯度用estmate包。
以下是具体教程。

##estimate估计肿瘤的TNM分期,也就是肿瘤的纯度。
##安装estimate包
library(utils)
rforge 
声明:本文内容由互联网用户自发贡献自行上传,本网站不拥有所有权,未作人工编辑处理,也不承担相关法律责任。如果您发现有涉嫌版权的内容,欢迎发送邮件至:qvyue@qq.com 进行举报,并提供相关证据,工作人员会在5个工作日内联系你,一经查实,本站将立刻删除涉嫌侵权内容。