Oncomine数据库免费下载数据技巧
oncomineR包需要配合插件Save as MHTML一起使用,所以,首先我们需要先来安装这个插件
oncomineR 在github上
devtools::install_github(‘yikeshu0611/oncomineR’)
使用save as MHTML来下载网页数据
调用oncomineR包
library(oncomineR)
整理数据
r = oncomine(‘Age.mhtml’)
head(r)
安装R包
source(“https://bioconductor.org/biocLite.R”)
biocLite(“rtracklayer”)
install.packages(“installr”)
if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE))
install.packages(“BiocManager”)
BiocManager::install(version = “3.12”)